Theo quy định, Kho bạc Nhà nước khu vực 5 quản lý địa bàn các tỉnh Bắc Ninh, Hải Dương và Thái Bình, trụ sở chính tại Hải Dương. Do trùng 2 ngày thứ 7 và chủ nhật nên đơn vị sẽ chính thức tiếp nhận hồ sơ giao dịch mới từ ngày 17/3/2025.

Về cơ cấu tổ chức, Giám đốc Kho bạc Nhà nước khu vực 5 là ông Nguyễn Huy Hoàng, nguyên Giám đốc Kho bạc Nhà nước Hải Dương và 8 Phó giám đốc.

Kho bạc Nhà nước khu vực V có 10 đơn vị tham mưu, giúp việc tại hội sở, gồm 5 phòng Nghiệp vụ; cùng các phòng: Kế toán Nhà nước; Thanh tra - Kiểm tra; Tài vụ - Quản trị; Tổ chức - Hành chính; Hỗ trợ giao dịch và Công nghệ thông tin.

Tại cấp cơ sở, Kho bạc Nhà nước khu vực V có 12 phòng giao dịch, gồm 5 phòng giao dịch tại Bắc Ninh, 4 phòng tại Thái Bình. Riêng Hải Dương có 3 phòng giao dịch tại trụ sở Kho bạc Nhà nước Kim Thành, Kho bạc Nhà nước Thanh Miện và Kho bạc Nhà nước Ninh Giang.

​